3000万年前,黑暗使世界陷入恐惧。最终光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。光之巨人也用尽了全力,在红色的星球上陷入长眠。时光流转,在地球和平同盟TPU紧急组建精英小组GUTS-SELECT时,主人公真中剑悟正在刚刚开拓的火星上作为植物学家安稳地生活着。但是有一天,超古代封印的黑暗突然再次来袭,打破了安稳宁静的生活。